Viene inaugurata nel 1912, con l’apertura della linea ferroviaria Casarsa-Pinzano (già nel 1967 il traffico passeggeri viene interrotto e nel 1987 termina anche il trasporto merci).
Nel 1914 viene completato il tratto Pinzano-Gemona del Friuli e, nel 1930, viene inaugurata la linea Pinzano-Sacile (per maggiori informazioni sulla ferrovia pedemontana).
La stazione di Pinzano, per la sua posizione strategica, ha avuto un ruolo importante nei conflitti mondiali. Purtroppo, di qui sono passati anche i treni che trasportavano i profughi friulani nel 1917 e i prigionieri di guerra in Germania e in Polonia.
Oggi, dal piazzale della stazione si può partire a piedi per l’Anello di Pinzano o si può prendere la ciclovia FVG3 in bicicletta.